重裝火力一字排開,真是令人目炫啊! 總計 16 Gb DDR2-800 RAM(黑色小盒), HDD 250 GB x2, 640GB x 2(黃色盒子), Q6600 四核心 CPU x2 (藍色盒子)，呵，別嚇到，這個兩台機器的內容， Q6600 還沒有雙 CPU 的主板問市，多的部份是另外一位苦主，委託代購的。
當 P3 計劃送出審核時,我沒有閒著, 馬上著手 P2 計劃, P2 主要是以軟體開發為主,所以我花了一點精神跟小朋友, 把計劃很久的 Genome analyzer(GA) 給架了起來, 會叫作 genesis II 是因為原來為我工作的機器 (Dell OptiPlex 755),當初也是為了打造GA分析平台量身的，OptiPlex 755 是台好機器，這台在我的背書下， 聽說後來我們單位又進了五六台他的兄弟姐妹。不過受限於公家機關採購的層層限制，GA gen I 有些地方仍不能全然按照規劃，例如無法使用raid 模式。另外一個打造新平台的理由是，我有了很深的體悟，我覺得做我們這一行，先進的硬體設備及分析實力只是條件之一，資料的收集及可用行也是很重要的關鍵，這一部份才是生物學的部份及分析核心，如果沒有一個適當的基地來累積這些點滴的收集，實在是很可惜的事，一定要在一開始，就把平台建立好，才能讓過去及未來的努力，可以有個累積的地方，這是ＧＡ最重要的資產，也是我生涯的基石。
留意了一下最近的光華報價，電腦組件的價格實在降到令人匪夷所思的地步（難怪最近電子股一遍綠油油），前兩年百萬級的運算力，現在兩萬元有找！實在沒有不敗的理由！想了很久，把規格訂出來，打造這一台窮人家的分析伺服器，跟大家分享一下：
##ReadMore##CPU:
intel Core 2 Quad Q6600 2.6GHz（NT 5800)
RAM:
Kinstone: 4 x 2Gb DDR2-800 (NT 4400)
Mainboard: MSI NEO2 FR (NT3650)
HDD:
WD 2500AKKS (7200 rpm, 250 Gb) x 2 => raid 0 (NT 2900)
WD 6400AKKS (7200 rpm, 640 Gb) x 1 (NT 2650)
Display card:
GIGABYTE GV-RX26T256H Radeon HD 2600XT 256MB (NT 1990)
Power:
海韻S12 II 430 W (NT 2650)
Case:
CoolerMaster 690 (NT2000)
主要元件
Genome analysis 有個特點，就是資料量極大，平行運算的需求強烈。所以要定規格也很簡單，記憶體能多大，就買多大，ＣＰＵ能加幾粒，就加幾粒。 當然個體戶沒有辦法去串一個PC cluster,或來個 Xeon 四核雙CPU. 不過我挑的這一粒Q6600也是很猛的， 這粒停產的ＣＰＵ，雖然是 65奈米製程的四核心老骨頭，但是 8 M 的快取，比新一代的CPU 還多，優異的超頻穩定性，不不用加壓就可以跑到 3.2GHz，就算某些單執行緒的軟體，用這個樣的時脈來跑，一點也不輸core 2 dual extreme 系列，更別提他在平行運算多了兩粒價值不變的優勢。一粒 6000 有找，實在是窮人伺服器的極品。
RAM一次到位，加到8 Gb 是一般主板的極限了，預計跑400 外頻，RAM 沒打算超，就隨便買啦。
(照片摘自官網）
主板也是很難抉擇的一項，我選的是NEO2FR 這片主板，在超頻界是很有口碑的，散熱上棌用高階主板有的銅導熱管，雖然沒有打算加壓超頻所以沒有過熱的問題，但是這類加強被動式的排熱設計，在通風良好的機箱中，可以省去不少主動散熱裝置（風扇）的成本，而主晶片組P35＋ICH9R 支援雙顯卡及RAID 0,1,5 磁碟機陣列，也符合未來 四螢幕及諸存系統擴充的需求。雖然現在P45,X38,48 的主板都已經出來了，不過能在４千有找內找符合需求，還是很難。而 新一代的晶片組，多出來的主要是對高時脈的支援，我的CPU跟記憶體都沒有打算在昇級了，沒有必要再多作投資。
Raid0 的硬碟測試
儲存媒體
Genome database 的資料量是在很驚人，所以儲存媒體也是很重要的，最近在玩的 hg18，單一的資料庫，就給我吃掉了184 Gb 的硬碟空間，這種怪獸級的DB 除了容量的問題外，當複雜的qeury 執行時，硬碟效能就成了關鍵。我當初著實的為了要不要這麼奢侈，組 磁碟機陣列猶豫了一陣，不過，爬了一些文之後心中就有了決定了，本來擔心內建的raid 晶片（ICH9R) 會效能不佳，不過看到了很多玩家的測試，raid0 這種低運算量的作業方式，ICH9R 還是很有用的，用四粒萬轉的硬碟，甚至可以逼上 300Mb/s 的極速，直逼DDR2記憶了，而我裝機的實測也有平均 147Mb/s，比單碟快上56%，而Raid 0 脆弱的資料安全性，就用一粒大硬碟在後面挺著，應該可以放心了。再來價位，兩顆250 只比 640 多出二百五十元，以效能上的增加，算起來很值得。一共花了5450，容量 1.14Tb, 比單顆1Tb 的硬碟還便宜，而且同時兼顧效能及安全。
GV-RX26T256H Radeon HD 2600XT
(照片摘自官網）
顯示卡:
我不玩３Ｄ Game，所以也就隨便買了一片，為啥選這片，因為他沒有吵人的風扇，又有硬體解碼，以後可以來放full HD，也支援 crossfire, 如果以後中了樂透可以用四螢幕時，就可以再來一片組雙顯卡了, 最重要的是，便宜，原價屋倒貨價 (NT 1990)，買回來用還蠻不錯的，vista beckmark 可以到 5.4 分，在我的機箱來也沒有過熱的問題。
海韻S12 II 430 W
(照片摘自官網）
電源及機殼
沒有吃電的發燒顯卡，就不必要考慮千瓦的power 了，就算哈滴全插滿，430瓦也足夠了！挑了海韻的power，因為牌子好，效率高，有過 80 plus, 而且有組裝價，便宜。
Case本來想把床底下的陳年舊殼拿來回收利用，不花腦筋，不過那殼現在已經被喵子據為己有了，看來沒商量了，只有另找新殼了。加上主板及顯卡是採用被動散熱的方法，機殼的散熱就變的很重要了。殼是最難決定的部件之一，像其它的零件還是有規格可循的，不過，不一樣的是殼有一個很重要的不同，就是要順眼，花了大把銀子搞了台夢幻機器，可是外表看起來面目可憎，這種感覺真是另人不快，而所謂順眼，可沒有什麼規則的，要一台一台看過才是了。找了半天，最後選這台CM690。果然英雄所見略同，它在網路上也很熱門的，相關的開箱文已經很多了，就不多作介紹，拆慣了名門的機器，就對這種無螺絲裝機以及硬碟架的設計，實在愛不釋手，CM 690 很有server 的味道，價錢上郤更有親和力！內部整線也乾乾淨淨的。隨機就附上 3個12吋，一個CPU背側的8吋風扇，幫我省了不少錢。
CoolerMaster 690
(照片摘自官網）
使用心得：
嗯，其實沒有什麼心得啦！用起來就是很爽！速度及穩定度都很好，裝機過程也很偷快，除了作業系統用 2003 x64 時，驅動程式很難找外，軟體安裝也沒什麼問題，後來我換了vista x64 驅動程式的問題就少了，一個下午就完成了大部份的軟體安裝，可以上工了，而真正的考驗也才剛開始。只前也說過，GA平台的重點在軟體，也是我目前在開發的 P2 計劃，等告一段落再來跟大家分享 GA gen2 的軟體建置。
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