DAVID 是我最常用的 Gene list annotation 工具,理由是他提供了非常方便的工具,讓你作 gene ID 的轉換,如果你用的是主流廠商的 microarray 晶片,幾乎可以直接 copy and past 你的 Gene List, 就可以完成大部份的 Gene annotation, 註解資訊包括了 Gene fucnton ,pathway, protein domain and interaction 包山包海.最重要的是 DAVID 的背後是NIH,硬體資源豐富,所以速度跟分析能力都很讓人滿意.
不過,唯一讓人抱怨的是他在資料庫的更新腳步有點慢,所以分析引用的資料有些過時.前一陣子回去逛,發現 DAVID 改版了,也更新了資料庫,所以趕快跟大家報告這個好消息.除了功能的增加及資料更新,我還發現了 NATURE 也出了一篇, DAVID step by step 的說 明文(呵,省下了我寫說明文的功夫),如果你對這超好用的工具不太熟,可以仔細的讀一下,會用這好物,可以讓你分析功力大增喔!Lucas 真心推薦...
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