micro-RNA 的命名

micro-RNA 是最近的當紅炸子雞，不過，目前跟我沒啥闗係，不過最近接了一個委託案，要分析 miRNA 的 Array，而最近不務正業很久了，連 mRNA 都快要忘了，更別提從來沒交過手的 micro RNA 了，所以做了點功課，順便上來作個筆記。 （有關 micro-RNA 的介紹，請參考 wikipedia）

其 實，一開始最令我的頭疼的是 microRNA 的命名，它不是 expression 的 RNA，所以跟 messenger RNA 的概念不同，沒有 protein 來說故事，描述的他的功能，所以大部分都是用 編號來命名（至少 sanger 系統是這樣），所以 他的名字是個代碼 (ex. hsa-miR-123a*)。

1.  hsa 物種名 hsa 是人類, cel 是線蟲....
2.  mir 表示  pre-miRNA, miR mature miRNA(請參考MicroRNA 生成圖）
3.  123 第123 個被發現的
4.  a-z 有數個相似的miRNA,  以 a,b,c… 區別
5.  -1-n  存在genome 不同位置、但miRNA 序列完全相同，只有 pre-miRNA 序列不同。
6.   *,-3p,-5p  (請參考MicroRNA 生成圖）pre-miRNA 形成時會形成 hair-pin，與其互補的RNA形成 stem 結構, mature mi-RNA 可以從3端或5端生成，通常只有一端會出現在細胞，所以不用加註。如果3端或5端差不多，則用 -3p/-5p 來區別，如果一端 數量遠少於另一端時，數量少的那一端稱為 miRNA* 

MicroRNA 命名編碼

MicroRNA 生成圖

  圖片來源 wikipedia

我當然不是 miRNA 的專家，所以有miRNA 分析的問題，請不要問我：P，如果上面說的有不正確之處，請不吝指正。

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